生物から分泌物などの形で放出され，水中や土壌に存在しているDNAを環境DNAと呼ぶ。環境DNAを調べることで，そこに生息している生物の種類や量などが分かる。水域における環境DNA調査は，生物を直接捕獲することがなく非侵略的なので，特に希少種や絶滅危惧種の調査に有効である。

河川下流域におけるニホンウナギの環境DNA濃度

三陸以南の太平洋側に多く，能登半島以北の日本海側と北海道ではほとんど検出されない。全国のニホンウナギの分布が環境DNA分析から明らかになった。